DNA 로딩 다이는 아가로스 또는 폴리아크릴아마이드 겔에서 DNA 이동을 추적하는 데 사용됩니다.
6X DNA Loading Dye - 조성
| 성분명 | 화학식 | 농도 | CAS |
|---|---|---|---|
| Tris-Cl (pH 7.6) | C₄H₁₁NO₃ | 10 mM | 77-86-1 |
| EDTA | C₁₀H₁₆N₂O₈ | 60 mM | 60-00-4 |
| 오렌지 G | C₁₆H₁₀N₂Na₂O₇S₂ | 0.4% (w/v) | 1936-15-8 |
| 브로모페놀 블루 | C₁₉H₁₀Br₄O₅S | 0.25% (w/v) | 115-39-9 |
| 자일렌 시아놀 FF | C₂₅H₂₇N₂NaO₆S₂ | 0.25% (w/v) | 2650-17-1 |
| Ficoll 400 | (C₁₂H₂₂O₁₁)n·(C₃H₅ClO)n | 15% (w/v) | 26873-85-8 |
멸균 및 보관
- 멸균: 필요하지 않음.
- 보관: 1 mL 튜브로 소분하여 4°C 또는 −20°C 보관.
주의사항
- DNA 로딩 다이 조성은 다양하며, 여기서는 대표 예시 하나를 제시합니다.
- 염료를 넣기 전(4단계 이전)에는 용액이 무색~연황색이며 다소 탁하게 보일 수 있습니다.
- 소량(예: 10 mL) 조제 시에는 최종 정용 전에 튜브 벽/뚜껑에 용액이 남지 않도록 하세요.
- 용액 점도가 높아 피펫팅이 어렵기 때문에, 적절한 용기를 사용하고 가능하면 한 용기에서 조제를 끝내세요.
- 염료 농도는 조정 가능합니다: 브로모페놀 블루/자일렌 시아놀 FF는 0.03-0.50% (w/v), 오렌지 G는 0.15-0.50% (w/v) 범위에서 사용하세요.
- 염료 농도가 높으면 시인성은 좋아지지만 공이동 DNA 밴드가 가려질 수 있으므로, 해당 상황에서는 낮은 농도를 사용하세요.
- Ficoll 400은 60% (v/v) 글리세롤 또는 40% (w/v) 수크로스로 대체할 수 있으며, 수크로스 용액은 냉동 보관하세요.
- Ficoll 함유 로딩 다이는 DNA를 겔 웰에 더 잘 가라앉게 하지만 비용이 더 높습니다.
- 3색 로딩 다이는 DNA 단편 분리를 더 직관적으로 보여주지만 비용이 더 높습니다.
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